Названо точное время появления штамм «омикрон»

Ученые из Пенсильванского университета (США) провели исследование, чтобы выявить происхождение штамма коронавируса «омикрон». Он распространяется по миру гораздо быстрее, чем другие патогены. За несколько месяцев он охватил 120 стран, сообщает Nature.

Известно, что SARS-CoV-2 произвел три основных варианта («альфа», «дельта» и «омикрон») примерно за 16 месяцев. Ученые назвали этот факт удивительным, поскольку «другие вирусы не совершают таких повторяющихся больших эволюционных скачков».

Авторы исследования проанализировали все 686 последовательностей «омикрона», которые были доступны к 7 декабря 2021 года. Они обнаружили, что «омикрон» относится к линии B.1.1, которая также включает альфа-вариант. Вместе с тем он генетически отличается от альфы, а также от любых других известных вариантов коронавируса.

Новое исследование позволило установить четкие временные рамки появления «омикрона». Напомним, впервые его выявили в Южной Африке и Ботсване в начале ноября 2021 года. Ретроспективное тестирование выявило образцы штамма у пациентов из Англии (тесты были взяты 1-3 ноября), Южной Африки, Нигерии и США (2 ноября).

Проведя анализ частоты мутаций в сотнях секвенированных геномов и оценив скорость распространения, ученые установили, что «омикрон» появился в конце сентября –начале октября 2021 года. Источником его распространения в южной Африке могла стать густонаселенная провинция Гаутенг между Йоханнесбургом и Преторией. Но поскольку в Йоханнесбурге находится крупнейший на африканском континенте аэропорт, штамм могли завезти туда из любой точки мира.

Известно, что «омикрон» обладает 50 мутациями по сравнению с исходным «уханьским» вариантом вируса. 30 из них связаны с аминокислотами в спайковом протеине 1, который помогает