При постановке диагноза HCV проводят ПЦР-тестирование на определение генотипа возбудителя. Существует 6 эпидемиологически значимых штаммов вируса гепатита С, встречающиеся во всем мире.
Каждый из них имеет свои отличительные особенности, которые отражаются на течении заболевания и выборе терапии. Независимо от генотипа для HCV характерно преимущественно бессимптомное и продолжительное развитие в теле хозяина, которое часто завершается циррозом, раком и внепеченочными осложнениями.